全新发布:外泌体样本收集指南-Umibio
样本制备原则1. 代表性原则取样的代表性关系到实验结果是否具有科学意义,应根据实验目的慎重选择取样方案。应做到实验组与对照组的样本在取材时间、部位、处理条件等方面尽可能保持一致,保证实验结果的可信度。2. 准确性原则准确记录代表性样本的各种特征数据,按要求(低温、迅速)采集、制备、贮存、运输,最终正确地按实验设计进行实验和数据处理。3. 迅速性原则样本质量影响实验结果的最关键因素,在采集、制备、贮存、运输过程中应尽可能地做到迅速,最大限度的缩短从样本采集到实验的时间。4. 低温原则所取样本离体后,应尽快置于干冰或-80℃冰箱中,并保证在实验前始终处于-70℃以下,以避免外泌体降解。
1. 贴壁/悬浮细胞1.1 细胞上清1. 贴壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;2. 加入适量的PBS 缓冲液冲洗一次,彻底去除FBS;3. 按每10cm皿(约107细胞)10ml培养基,换无血清替代培养基培养至少48hr(细胞融合率至少70%以上);4. 48hr后,收集细胞上清,并于3000×g离心15min,去除细胞或细胞碎片;5. 放入-80℃冰箱中保存。注意事项: 1、细胞生长正常。换无血清替代培养基(或无外泌体血清培养基)时的细胞密度与收培养上清时的细胞密度,一定要有显著增长,例如从60~70%长到90~95%。如细胞无显著增殖生长无须收样检测,因基本无多少外泌体分泌。避免细胞长得过满导致细胞凋亡,细胞凋亡可能降解外泌体2、及时离心处理。收集细胞上清后第一时间离心去除细胞及细胞碎片,离心后的细胞上清再放入 -80℃冰箱保存,避免外泌体因细胞及细胞碎片存在而导致外泌体降解。3、无血清替代培养基并非指的是DMEM、1640 此类基础培养基,而是可以正常维持细胞生长的无血清替代培养基。2. 血液外泌体血液样本提取时,请大家注意血清和血浆都可以正常提取。如果提供全血,是无法完成的,必须提前做好血清或者血浆的分离。以下是全血、血浆、血清的区别1、全血:通过采血管采集后,经过抗凝处理的全部血液。2、血浆:经过抗凝处理的全血,进行低速离心后的上清液,为淡黄色液体。3、血清:不经过抗凝处理的血液,让它自行凝固,在进行低速离心后的上清液,为淡黄色液体。全血经过长时间放置,或通过冷冻、或高速离心后,会发生溶血,此时无法提取外泌体。所以,一定要提前做好血清或者血浆的分离,并且采血后尽快进行分离,期间不能经过冷冻,离心时转速不能太高,离心后取上清即可。
具体血液样本操作如下:
采血时间一般为早晨或上午
血浆:将抗凝管收集的全血2mL,迅速涡旋或用移液器Tip混匀;
血清:收集不加抗凝剂的全血2mL,加入到离心管或促凝管中,凝血后进行下一步离心;
2. 在1小时(室温条件下)或2小时(4℃条件下)内进行下面的操作:4℃,1900g(1568rpm)离心10分钟;3. 吸取约1mL上清转至洁净的1.5 mL 离心管中,16,000g (13,200rpm),4℃,离心10分钟,小心吸取上清到新的离心管中;4. 放入-80℃冰箱中保存;5. 填写样本登记单,记录样本名称、组织类型、编号、取样日期、样本处理过程等情况。3. 组织液3.1 尿液1. 收集尿液时,应该尽量选择受试者的“新鲜”尿液20ml,并注意避免细菌污染,收集前注意对饮食的控制;2. 并于3000×g离心15min,去除细胞或细胞碎片;3. -80℃冰箱中保存;4. 填写样本登记单,记录样本名称、组织类型、编号、取样日期、样本处理过程等情况。3.2 脑脊液1. 收集集脑脊液10ml,避免受到血液污染;2. 并于3000×g 离心15min,去除细胞或细胞碎片;3. -80℃冰箱中保存;4. 填写样本登记单,记录样本名称、组织类型、编号、取样日期、样本处理过程等情况。4. 外泌体1. 收集细胞上清或组织液10ml(血清1ml),抽提外泌体后,用100μL-500μLBuffer重悬沉淀(所用buffer 根据下游的蛋白分析则用蛋白裂解液, RNA分析则TriZol裂解);2. 检测浓度,蛋白浓度≥1ug/ul,RNA浓度≥50ng/ul;3. 放入-80℃冰箱中保存。
样本类型
所需样本参考量(体积)
表征检测 (电镜、粒径、Marker蛋白检测)
组学研究 (NGS测序/蛋白质组)
细胞上清*
20 mL
50-60 mL
血 清
1 mL
2 mL
血 浆
1 mL
2 mL
尿 液
20 mL
50-60 mL
脑脊液
10 mL
20-30 mL
腹 水
10 mL
20-30 mL
羊 水
10 mL
20-30 mL
乳 液
5 mL
10-20 mL
精液
1 mL
2-4 mL
唾 液
5 mL
10-20 mL
备注:
*细胞上清液:
指常见的肿瘤细胞,如HeLa、A549、HepG2等; 然而神经细胞、干细胞分泌的外泌体量是肿瘤细胞的1/5~1/10左右,因此所需培养基上清量是肿瘤细胞的5-10倍。
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